[DJ Mogarych]

Можете попробовать сразу запустить Foxit Reader из командной строки сразу после установки, а потом закрыть (можно паузу поставить секунд 5 перед закрытием, на всякий случай). Foxit Reader при запуске проверяет ассоциацию с pdf, и предлагает установить себя по умолчанию, если обнаруживает, что какая-то другая программа "владеет" ассоциацией. Возможно, что если никаких программ для работы с pdf, кроме Foxit Reader-a не стоит, возможен и такой вариант, что Foxit молча возьмёт на себя этот груз.
В конце концов, ничего не стоит просто один раз запустить Foxit Reader вручную, и ассоциировать его с pdf. Это дело 5 секунд.