[Guest]

Какие программы надо запускать автостартом в ключах Run* читает Explorer.
Программы, которые прописаны в ключе WinLogon читает WinLogon (точнее WinLogon и UserInit, запускаемый этим WinLogon-ом).
Есть еще проги, которые запускает диспетчер сеансов, или как его правильнее по русски назвать (например, автопроверка дисков при старте), но оттуда мало что можно запустить, и проги этот ключ не юзают (может их авторы не знают о нем, а может потому, что туда права только у админов есть).