Я думаю, что следующая информация будет полезна многим. Практически все значения я проверил собственноручно. В комментариях всё написано. Некоторые параметры в пункте "Разное" ещё из Win98se и их я не проверял в WinXP. Вот защиту системных файлов Windows я так и не смог пока победить.
Точкой с запятой у меня просто отключены ненужные мне пункты.
Пришлось поделить файл на 6 частей, более 10000 символов не разрешают писать. см далее.
1я часть файла RegTweaks.reg
Код:

Windows Registry Editor Version 5.00
;-----------------------------------------------------------------------------------
; Надо учесть, что некоторые ключи нельзя изменить с помощью этого файла. Скорее всего Windows блокирует часть реестра, но вручную их можно редактировать. Так было в Win98se. В WinXP пока всё проходит.
;-----------------------------------------------------------------------------------
;---------------------------------
;Оптимизация операционной системы
;---------------------------------
;Увеличение производительности NTFS - НЕ ПРОВЕРЯЛ
;[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\FileSystem]
;"Win31FileSystem"=dword:00000000
;"Win95TruncatedExtensions"=dword:00000001
;"NtfsDisableLastAccessUpdate"=dword:00000001
;Prefetcher tweak(Уменьшение времени загрузки ) - РАБОТАЕТ, но непонятно
;[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager\Memory Management\PrefetchParameters]
;"EnablePrefetcher"=dword:00000003
;Улучшение работы с памятью - Тоже всё это под вопросом
;[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager\Memory Management]
;"DisablePagingExecutive"=dword:00000001
;"LargeSystemCache"=dword:00000001
;"IoPageLockLimit"=dword:1bf00000
;"SecondLevelDataCache"=dword:00000100
;Отключить "Автоматическая перезагрузка в случае BSOD" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\CrashControl]
"AutoReboot"=dword:00000000
;Отключить "Отправить административное оповещение в случае Отказа системы" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\CrashControl]
"SendAlert"=dword:00000000
;Отключить "Мастер очистки рабочего стола" (Desktop Cleanup Wizard) - РАБОТАЕТ
;[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Desktop\CleanupWiz]
;"NoRun"=dword:00000001
[HKEY_USERS\.DEFAULT\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Desktop\CleanupWiz]
"NoRun"=dword:00000001
;Отключить сообщения об ошибках, но оставить уведомление о критических ошибках - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\PCHealth\ErrorReporting]
"DoReport"=dword:00000000
;Не использовать простой общий доступ к файлам (simple file sharing) - НЕ ПРОВЕРЯЛ
;[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Lsa]
;"forceguest"=dword:00000000
;Ускорить работу с сетевыми дисками, убирая запланированные сетевые задания (Network Scheduling Tasks) - НЕ ПРОВЕРЯЛ
;[-HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\RemoteComputer\NameSpace\{D6277990-4C6A-11CF-8D87-00AA0060F5BF}]
;Убрать стрелки у ярлыков - РАБОТАЕТ
[HKEY_CLASSES_ROOT\lnkfile]
"IsShortcut"=-
;Отключить приглашение на "Тур по Windows" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Applets\Tour]
"RunCount"=dword:00000000
;Отключить "Знакомство с системой" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\ShellServiceObjectDelayLoad]
"PostBootReminder"=-
;Все настройки рабочего стола по умолчанию для всех пользователей
[HKEY_USERS\.DEFAULT\Control Panel\Desktop]
"AutoEndTasks"="1"
"CaretWidth"=dword:00000002
"CursorBlinkRate"="530"
"DragFullWindows"="2"
"MenuShowDelay"="400"
"ScreenSaverIsSecure"="0"
"ScreenSaveTimeOut"="600"
"ScreenSaveActive"="1"
"TileWallpaper"="0"
"WaitToKillAppTimeout"="4000"
"Wallpaper"="%SystemRoot%\Web\Wallpaper\BLACKCOMB1280.BMP"
"WallpaperStyle"="2"
"WheelScrollLines"="3"
"SCRNSAVE.EXE"=-
;Установить обои рабочего стола - РАБОТАЕТ
;[HKEY_CURRENT_USER\Control Panel\Desktop]
;"Wallpaper"="%SystemRoot%\Web\Wallpaper\BLACKCOMB1280.BMP"
;Растянуть обои на раабочем столе - РАБОТАЕТ
[HKEY_CURRENT_USER\Control Panel\Desktop]
"WallpaperStyle"="2"
"TileWallpaper"="0"
;Отключить "Разрешить отправку приглашения удалённому помощнику" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Terminal Server]
"fAllowToGetHelp"=dword:00000000
;Отключить "Поддержку удалённого рабочего стола" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\ControlSet001\Control\Terminal Server]
"fDenyTSConnections"=dword:00000001
;Отключить "Восстановление системы" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\SystemRestore]
"DisableSR"=dword:00000001
;Убрать автоматический поиск сетевых папок и принтеров - РАБОТАЕТ
[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced]
"NoNetCrawling"=dword:00000001
;Корзина использует 3% от доступного места на диске (не 10%) - НЕ ПРОВЕРЯЛ
;[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\BitBucket]
;"Percent"=dword:00000003
;Отключить все автоматические обновления системы. Вообще Всё становится недоступно, серое - РАБОТАЕТ
;[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Policies\Microsoft\Windows\WindowsUpdate\AU]
;"NoAutoUpdate"=dword:00000001
;Отключить автоматическое обновление системы - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\WindowsUpdate\Auto Update]
"AUOptions"=dword:00000001
"AUState"=dword:00000007
;Выгрузка динамических библиотек из памяти после закрытия программ - В реестре этого значения нет - НЕ ПРОВЕРЯЛ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer]
"AlwaysUnloadDLL"=dword:00000001
;Отключение отладчика Dr.Watson - НЕ ПРОВЕРЯЛ - В реестре значение по умолчанию 1
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\AeDebug]
"Auto"="0"
;-------------------
;Оптимизация служб Windows
;-------------------
;отключение защиты системных файлов Windows - Поискать другой способ, этот не работает
;[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Winlogon]
;"SFCDisable"=dword:ffffff9d
;"SFCQuota"=dword:ffffffff
;"SFCSetting"=dword:ffffff9d
;Отключить "Автоматическое обновление Windows" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\wuauserv]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Центр обеспечения безопасности" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\wscsvc]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Служба сообщений" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\Messenger]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Удаленный доступ к реестру" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\RemoteRegistry]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Служба времени Windows" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\W32Time]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Служба регистрации ошибок" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\ERSvc]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Оповещатель" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\Alerter]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Фоновая интеллектуальная служба передачи BITS" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\BITS]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Диспетчер сеанса справки для удаленного рабочего стола" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\RDSessMgr]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Маршрутизация и удаленный доступ" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\RemoteAccess]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Вторичный вход в систему" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\seclogon]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Справка и поддержка" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\helpsvc]
"Start"=dword:00000004
;Вручную "Планировщик заданий" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\Schedule]
"Start"=dword:00000003
;Отключить "Источник бесперебойного питания" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\UPS]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Служба восстановления системы" - РАБОТАЕТ
;[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\srservice]
;"Start"=dword:00000004
;Отключить "Служба индексирования" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\CiSvc]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Беспроводная настройка" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\WZCSVC]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Смарт-карты" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\SCardSvr]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Служба серийных номеров переносных устройств мультимедиа" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\WmdmPmSN]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Служба COM записи компакт-дисков IMAPI" - РАБОТАЕТ
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\ImapiService]
"Start"=dword:00000004
;Отключить "Драйвер фильтра записи компакт-дисков" - ЭТО ОТКЛЮЧАТЬ НЕЛЬЗЯ, ПРОПАДАЕТ ДИСКОВОД ИЗ СИСТЕМЫ
;[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\Imapi]
;"Start"=dword:00000004