[lxa85]

Vadikan, прицепил 2 файлика.
Система изначально устанавливалась на 1 жесткий диск, и некоторое время с ним работала. С каждодневным выключением и т.д.
Дополнительный IDE появился позже, и почему он начал оказывать влияние на процесс загрузки мне не совсем понятно. В BIOS последовательность загрузки не менялась, установок ОС не производилось.
Т.е. теоретически не было ничего, что могло бы, в моем понимании, затереть, изменить или каким либо образом затронуть загрузчик.

P.S. Да, были в моей практики случаи работы Windows при достаточно хитрой дисковой конфигурации, запоминание этой конфигурации и т.д., но это к делу не относится.